為學術討論、展覽和科學出版物提供的顯微照片中，有80％ 至90％ 被錯誤更正，而且其標本的照明質(zhì)量很差，這種情況并不罕見。主要原因是光源調(diào)節(jié)不好，使標本得不到足夠的光照。熟練和認真的操作員不僅能熟練地糾正，而且能夠練習標本上的差異和金相顯微鏡的差異。

金相顯微鏡透鏡的缺點是：鏡頭霧化，霉變，損壞，脫膠，表面涂層損壞或丟失。

1.霧是指透鏡表面有一層水霧型、油裂型、水基型和油水混合型三種類型。或者因為氣體溫度的急劇變化，它形成于鏡片表面，凝結(jié)成微小的液滴。霧場是鏡頭發(fā)霉或起動的現(xiàn)象，它變得模糊不清，分辨率降低。它們的形成與光學玻璃制造、化學穩(wěn)定性、環(huán)境條件的使用和維護等諸多因素有關。使用后立即將鏡頭放置在烘干機中并密封光學系統(tǒng)。

2.為了改善光學零件表面的化學性質(zhì)，涂覆了不同性質(zhì)的薄膜。平時保養(yǎng)擦拭鏡片時，如果布不干凈，很容易劃傷涂層。

3.光路臟或長霉：可導致金相顯微鏡觀察效果明顯下降，具體分析研究可通過拔下向鏡筒里的目鏡來觀察，如光路有長霉或大塊的污物，可被清晰的觀察到，同時也可以選擇通過轉(zhuǎn)動各個光學部件來準確判斷污物和霉斑的位置，如光路只是由于工作時間的關系積塵太多，也可以看到光路不夠透亮。